MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.08

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019756	CCA	2	6	249	254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308242
2	NC_019756	TTA	2	6	283	288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308242
3	NC_019756	CTAG	2	8	393	400	25 %	25 %	25 %	25 %	428308242
4	NC_019756	T	6	6	472	477	0 %	100 %	0 %	0 %	428308242
5	NC_019756	TAT	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308242
6	NC_019756	A	6	6	752	757	100 %	0 %	0 %	0 %	428308242
7	NC_019756	TGC	3	9	833	841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308242
8	NC_019756	AAT	2	6	874	879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308242
9	NC_019756	CTT	3	9	967	975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308243
10	NC_019756	T	6	6	1018	1023	0 %	100 %	0 %	0 %	428308243
11	NC_019756	CAG	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308243
12	NC_019756	T	6	6	1072	1077	0 %	100 %	0 %	0 %	428308243
13	NC_019756	GCT	3	9	1153	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308243
14	NC_019756	ATT	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308243
15	NC_019756	GTT	2	6	1325	1330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308243
16	NC_019756	TAGA	2	8	1492	1499	50 %	25 %	25 %	0 %	428308243
17	NC_019756	TGC	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308243
18	NC_019756	CGTT	2	8	1557	1564	0 %	50 %	25 %	25 %	428308243
19	NC_019756	A	6	6	1590	1595	100 %	0 %	0 %	0 %	428308243
20	NC_019756	ACG	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308244
21	NC_019756	ATG	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308244
22	NC_019756	TA	4	8	1831	1838	50 %	50 %	0 %	0 %	428308244
23	NC_019756	ATG	2	6	1947	1952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308244
24	NC_019756	GA	3	6	1958	1963	50 %	0 %	50 %	0 %	428308244
25	NC_019756	GAA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308245
26	NC_019756	T	6	6	2285	2290	0 %	100 %	0 %	0 %	428308245
27	NC_019756	GCTG	2	8	2344	2351	0 %	25 %	50 %	25 %	428308245
28	NC_019756	CGAT	2	8	2377	2384	25 %	25 %	25 %	25 %	428308245
29	NC_019756	CTC	2	6	2412	2417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308245
30	NC_019756	GTCA	2	8	2475	2482	25 %	25 %	25 %	25 %	428308245
31	NC_019756	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308245
32	NC_019756	CTG	2	6	2533	2538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308245
33	NC_019756	CAT	2	6	2539	2544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308245
34	NC_019756	AT	3	6	2543	2548	50 %	50 %	0 %	0 %	428308245
35	NC_019756	AGC	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308245
36	NC_019756	T	6	6	2618	2623	0 %	100 %	0 %	0 %	428308245
37	NC_019756	ACG	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308245
38	NC_019756	CGA	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308245
39	NC_019756	TAT	2	6	3155	3160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308246
40	NC_019756	GTA	2	6	3184	3189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308246
41	NC_019756	AACA	2	8	3451	3458	75 %	0 %	0 %	25 %	428308247
42	NC_019756	A	7	7	3469	3475	100 %	0 %	0 %	0 %	428308247
43	NC_019756	ATT	2	6	3617	3622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308247
44	NC_019756	TA	3	6	3658	3663	50 %	50 %	0 %	0 %	428308247
45	NC_019756	AGC	3	9	3674	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308247
46	NC_019756	AAAGCT	2	12	3741	3752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428308247
47	NC_019756	AAG	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308247
48	NC_019756	A	6	6	4010	4015	100 %	0 %	0 %	0 %	428308247
49	NC_019756	CAGG	2	8	4022	4029	25 %	0 %	50 %	25 %	428308247
50	NC_019756	AAG	2	6	4101	4106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308247
51	NC_019756	TGG	2	6	4235	4240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308247
52	NC_019756	TGA	2	6	4316	4321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308247
53	NC_019756	GAA	2	6	4355	4360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308247
54	NC_019756	TAG	2	6	4369	4374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308247
55	NC_019756	AACT	2	8	4379	4386	50 %	25 %	0 %	25 %	428308247

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.